分子动力学（Molecular Dynamics, MD）是研究分子行为与相互作用的关键技术，广泛应用于药物设计、蛋白工程、材料模拟等领域。
致一生物基于GROMACS平台，结合AI辅助建模与增强采样策略，支持蛋白、核酸、膜系统等多类型体系的动态行为预测与分析。
| 应用领域 | 具体内容 | 关键指标示例 |
| 药物研发 | 蛋白-药物结合自由能、耐药突变模拟、共价结合预测 | ΔG_binding、RMSF、氢键寿命 |
| 蛋白工程 | 热稳定性分析、别构效应路径分析、修饰影响评估 | Φ/ψ角度、SASA、盐桥网络 |
| 核酸研究 | CRISPR复合体模拟、DNA甲基化/修饰效果、LNA稳定性分析 | 螺旋度、碱基对平衡、静电势能面 |
| 膜系统模拟 | 膜蛋白稳定性、脂质渗透、纳米材料相互作用机制 | 序参数S_CD、扩散系数、电子密度分布 |
| 工业酶设计 | 底物通道分析、有机溶剂耐受、辅因子结合模式 | 通道半径（CAVER）、结合口袋体积、Km优化 |
1、多种力场支持： CHARMM36、AMBER、OPLS-AA 等高精度力场任选
2、系统可修饰化： 支持共价修饰、非天然氨基酸、金属离子等模拟需求
3、增强采样算法： 包括元动力学、REMD等，提升罕见事件捕捉效率
4、全流程定制化分析： 提供完整模拟流程与关键指标报告，助力科学决策
