蛋白与小分子之间的结合行为是药物发现的核心环节。通过计算模拟,我们可以预测其结合位点、亲和力及关键相互作用机制,从而加速药物筛选与机制研究。

系统概述

致一生物自主构建的蛋白-小分子互作智能筛选系统,融合AlphaFold3、AutoDock Vina等先进算法,覆盖蛋白结构预测、小分子库构建、虚拟筛选、能量打分及结合模式分析等关键流程,提供高通量、高准确度的互作预测服务。

核心应用场景

1、靶点验证: 鉴定蛋白上潜在的小分子结合位点,辅助功能定位与机制解析。

2、候选化合物筛选: 通过三轮虚拟筛选识别高亲和力小分子,提高实验命中率。

3、结合模式解析: 揭示关键残基与分子间作用力,支持结构优化。

4、突变影响评估: 预测蛋白突变对结合稳定性与亲和力的影响。

5、机制研究与副作用预警: 协助分析药物作用通路及可能的脱靶效应。

技术亮点

1、高精度建模: AlphaFold3构建蛋白三维结构,确保对接精度。

2、柔性对接机制: 模拟结合口袋的动态变化,更贴近生理状态。

3、多轮筛选策略: 从粗筛到精筛再到AI优化(NeuralPlex可选),提高筛选效率与准确度。

4、多维评分体系: 包括结合自由能、口袋化学环境与分子稳定性等指标。

5、AI辅助结构优化: 基于LigandMPNN优化小分子结构,提升结合选择性。

致一生物致力于为药物研发与作用机制研究提供高效、可靠的蛋白-小分子互作解决方案,加速候选药物的发现与验证。

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